일본 나가사키, 미 해군 대위 핀커턴은 열다섯 살의 꽃다운 게이샤 조초 상과 결혼한 후 미국으로 떠난다. 조초 상의 하녀 스즈키는 미국으로 떠난 핀커턴이 돌아 올 것 이라고 염려하지만, 조초 상은 언젠가 핀커턴이 “나비야!”라고 부르며 나타날 것이라고 굳게 믿는다. 미국에서 핀커턴은 케이트와 결혼하고 조초 상 사이에서 난 아이를 미국으로 데려오기 위해 아내...