구조 설계 엔지니어 마이클 스코필드는 형 링컨이 부통령 동생을 살해했다는 누명을 쓰고 사형을 선고받자 직접 구출할 계획을 세운다. 그는 교도소의 구조와 탈출에 필요한 정보를 몸의 문신 속에 감춘 뒤, 일부러 은행 강도를 저질러 형과 같은 감옥에 들어간다. 그러나 설계도와 계산만으로 준비한 탈출은 교도관의 감시와 수감자들의 이해관계 앞에서 조금씩 어긋난다. ...