더 이상 이곳에 있을 필요가 없다는 말을 하며 자살한 요모타 치사. 중학생 2학년 이와쿠라 레인은 얼마 전 자살한 치사로부터 한 메일을 받게 된다. 자신의 육체는 죽었지만 정신은 와이어드(가상세계)에서 살아있다는 내용이었다. 레인은 이를 계기로 와이어드라는 가상 세계에 흥미를 갖게 되고 아버지가 사준 최신 컴퓨터 ‘나비’를 통해 와이어드에 접속한다. 그러나...