한때 영화를 누리던 일본의 닌자들은 전후 GHQ에 의해 조직히 해체되어 소멸되었다. >>그러나 실은 지금도 닌자들은 비밀리에 존재하고 있으며 그 수는 20만명에 이른다고도 한다. 그리고 일부의 정예닌자는 국가단위의 분쟁에서 암약하고 있다. 한편으로 말단닌자들은 임무가 없는것이 빈번한데 그중 한명인 쿠모카쿠레 쿠로도 니트와 다를바없이 생활하고 있다....